ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN
TRƢỜNG ĐẠI HỌC SƢ PHẠM
-------
TRẦN THỊ KIM DUNG
NGHIÊN CỨU PHÂN LẬP CÁC YẾU TỐ ĐIỀU KHIỂN
BIỂU HIỆN GEN UBIQUITIN TỪ HAI LOẠI BÈO TẤM LEMNA
AEQUINOCTIALIS DB1 VÀ SPIRODELA POLYRHYZA DB2
LUẬN VĂN THẠC SỸ SINH HỌC
Thái Nguyên – 2009
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN
TRƢỜNG ĐẠI HỌC SƢ PHẠM
-------
TRẦN THỊ KIM DUNG
NGHIÊN CỨU PHÂN LẬP CÁC YẾU TỐ ĐIỀU KHIỂN
BIỂU HIỆN GEN UBIQUITIN TỪ HAI LOẠI BÈO TẤM LEMNA
AEQUINOCTIALIS DB1 VÀ SPIRODELA POLYRHYZA DB2
Chuyên ngành: Di truyền học
Mã số: 60.42.30
LUẬN VĂN THẠC SỸ SINH HỌC
NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: TS. TRẦN THỊ PHƢƠNG LIÊN
Thái Nguyên – 2009
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
LỜI CẢM ƠN
Trước hết, tôi xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành và sâu sắc tới TS. Trần Thị
Phương Liên – phòng Công nghệ ADN Ứng dụng – Viện Công nghệ Sinh học đã
tận tì nh hướng dẫn và dì u dắt tôi trong quá trì nh hoàn thành luận văn.
Luận văn này được thực hiện tại Phòng thí nghiệm trọng điểm Công nghệ
gen với sự hỗ trợ kinh phí của Đề tài nhánh: “Thiết kế vector tái tổ hợp mang gen
H5N1 để chuyển vào bèo tấm” thuộc đề tài: Nghiên cứu tạo giống bèo tấm mang
gen kháng nguyên H5N1 phòng chống bệnh cúm ở gia cầm thuộc Chương trình
Công nghệ Sinh học Nông nghiệp 2007-2010.
Tôi xin chân thành cảm ơn lãnh đạo Viện Công nghệ sinh học và các thầy cô
giáo trong khoa Sinh – KTNN, Trường Đại học Sư phạm Thái Nguyên , Đại học
Thái Nguyên đã giảng dạy và tạo điểu kiện cho tôi học tập và thực hiện luận văn.
Tôi xin bày tỏ biết ơn tới toàn thể các cán bộ Phòng Công nghệ ADN Ứng
dụng, Viện Công nghệ sinh học , đặc biệt là PGS.TS. Nông Văn Hải – Trưởng
phòng Công nghệ ADN Ứng dụng , KS. Hà Hồng Hạnh đã giúp đỡ và chỉ bảo tôi
rất tận tì nh trong suốt thời gian tôi thực tập và thực hiện luận văn vừa qua.
Tôi xin chân thành cảm ơn Viện Di truyền Nông nghiệp đã cung cấp nguyên
liệu bèo tấm cho luận văn.
Cuối cùng , tôi xin dành cho gia đì nh và bạn bè lòng biết ơn sâu sắc vì sự
quan tâm, động viên và góp ý cho tôi trong suốt quá trì nh học tập và hoàn thành
khóa luận.
Học viên
Trần Thị Kim Dung
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
LỜI CAM ĐOAN
Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của tôi. Các số liệu, kết quả
nêu trong luận văn là trung thực và chưa từng được công bố trong bất kỳ công trình
nào khác.
Thái Nguyên, ngày
tháng
năm 2009
Tác giả luận văn
Trần Thị Kim Dung
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
NHƢ̃NG TƢ̀ VIẾT TẮT
Amp
Ampicilin
DNA
Deoxyribonucleic acid
ATP
Adenosine triphosphate
bp
Base pair (cặp bazơ)
dNTP
Deoxynucleoside triphosphate
ddNTP
Dideoxynucleoside triphosphate
E. coli
Escherichia coli
EDTA
Ethylene diamine tetra-acetic acid
epp
Eppendorf
EtBr
Ethidium bromide
IPTG
Isopropyl thio-β-D-galactoside
kb
Kilo base
LB
Luria – Bertani
PCR
Polymerase Chain Reaction
RNase
Ribonuclease
RNA
Ribonucleic acid
SDS
Sodium Dodecyl Sulphate
SHPT
Sinh học phân tử
TAE
Tris – acetate – EDTA
X - gal
v/p
5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactocide
vòng/phút
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
DANH MỤC CÁC BẢNG
Bảng
Tên bảng
Trang
1.1
Kích thước gen nhân của một số loài bèo tấm
8
1.2
Thành phần và hàm lượng các hợp chất hữu cơ có trong cánh bèo
9
3.1
Các vị trí nucleotide khác biệt giữa Sp-Ubi-pin (Mỹ) với pJETSpUbipin6 và
43
pJETSpUbipin6R
3.2
Các vị trí nucleotide khác biệt giữa La-Ubi-pin (Mỹ) với La-Ubi-10F
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
50
DANH MỤC CÁC HÌNH
Hình
Tên hình
Trang
1.1
Hoa của Lemna gibba
5
1.2
Cây phân loại bèo tấm theo Landolt và cộng sự
5
1.3
Sinh sản vô tính bằng hình thức nảy chồi ở S. polyrrhiza
6
1.4
Sơ đồ cấu trúc gen điển hình
11
1.5
Sơ đồ cấu tạo promoter nhóm II ở sinh vật nhân chuẩn
12
1.6
Cấu trúc hệ thống điều khiển Ubiquitin ở thực vật
14
2.1
1. Lemna aequinoctialis DB1; 2. Spirodela polyrrhiza DB2
21
3.1
Điện di DNA tổng số trên gel agarose 0,8%
33
3.2
Sơ đồ cấu trúc đoạn các yếu tố điều khiển biểu hiện gen ubiquitin của loài
34
bèo tấm Spirodela polyrrhiza DB2 (Mỹ) và vị trí các mồi.
3.3
Điện di sản phẩm PCR trên gel agarose 0,8%
36
3.4
Điện di plasmid trên gel agarose 0,8%
38
3.5
Điện di sản phẩm xử lý DNA plasmid bằng enzyme
39
3.6
Trình tự đoạn các yếu tố điều khiển biểu hiện gen ubiquitin của loài bèo tấm
40
Spirodela polyrrhiza DB2 với dự đoán các vùng chức năng promoter
3.7
Sơ đồ cấu trúc đoạn các yếu tố điều khiển biểu hiện gen ubiquitin của loài
44
bèo tấm Lemna aequinoctialis DB1 và vị trí các mồi.
3.8
Điện di sản phẩm PCR trên gel agarose 0,8%
45
3.9
Điện di plasmid trên gel agarose 0,8%
47
3.10
Điện di sản phẩm xử lý DNA plasmid bằng enzyme
48
3.11
Trình tự đoạn promoter của loài bèo tấm Lemna aequinoctialis DB1 với dự
49
đoán các vùng chức năng promoter
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
MỤC LỤC
Lời cam đoan
Những từ viết tắt
Danh mục các bảng
Danh mục các hình
Mục lục
Trang
MỞ ĐẦU
1
Chƣơng 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU
3
1.1. Giới thiệu chung về cây bèo tấm
3
1.1.1. Phân bố của bèo tấm
3
1.1.2. Đặc điểm hình thái bèo tấm
3
1.1.3. Cây phân loại bèo tấm
5
1.1.4. Hình thức sinh sản của bèo tấm
5
1.1.5. Hệ gen của bèo tấm
7
1.1.6. Giá trị dinh dưỡng
8
1.1.7. Tiềm năng sử dụng bèo tấm trong công nghệ sinh học
9
1.2. Promoter và ứng dụng trong công nghệ gen thực vật
10
1.2.1. Cấu trúc gen sinh vật
10
1.2.2. Cấu trúc promoter
11
1.2.3. Vai trò biểu hiện gen của promoter
13
1.2.4. Phân loại promoter
13
1.2.5. Ứng dụng promoter trong công nghệ gen thực vật
15
1.3. Tình hình nghiên cứu chuyển gen ở bèo tấm
17
1.3.1. Tình hình nghiên cứu trên thế giới
17
1.3.2. Tình hình nghiên cứu ở Việt Nam
19
Chƣơng 2. NGUYÊN LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CƢ́U
21
2.1. Nguyên liệu
21
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
2.1.1. Nguyên liệu thực vật
21
2.1.2. Hóa chất
21
2.1.3. Thiết bị
22
2.2. Phương pháp nghiên cứu
22
2.2.1. Phương pháp tách chiết DNA tổng số từ thực vật
22
2.2.2. Phương pháp điện di DNA trên gel Agarose
24
2.2.3. Nhân gen bằng kỹ thuật PCR
24
2.2.4. Các phương pháp sử dụng để tách dòng gen
26
2.2.5. Xác định trình tự gen
30
2.2.6. Xử lý số liệu bằng các phần mềm chuyên dụng
30
Chƣơng 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
31
3.1. Tách chiết DNA tổng số từ bèo tấm
31
3.2. Phân lập đoạn các yếu tố điều khiển biểu hiện gen ở loài S. polyrhiza
33
3.2.1. Thiết kế và tổng hợp cặp mồi đặc hiệu cho đoạn promoter
33
3.2.2. Nhân đoạn DNA bằng kỹ thuật PCR và tách dòng trong vector pJET1.2
33
3.2.3. Xác định đoạn điều khiển biểu hiện gen bằng RE
38
3.2.4. Xác định và phân tích trình tự đoạn promoter.
39
3.3. Phân lập đoạn các yếu tố điều khiển biểu hiện gen ở loài L. aequinoctialis
43
3.3.1. Thiết kế và tổng hợp cặp mồi đặc hiệu cho đoạn promoter
43
3.3.2. Nhân đoạn DNA bằng kỹ thuật PCR và tách dòng trong vector pCR1.2
44
3.3.3. Xác định đoạn điều khiển biểu hiện gen bằng RE
46
3.3.4. Xác định và phân tích trình tự đoạn promoter.
48
KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ
53
TÀI LIỆU THAM KHẢO
54
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
MỞ ĐẦU
Khi con người có cuộc sống định cư, khoảng 8000 năm trước Công nguyên,
ở khu vực Tiểu Á và lưu vực sông Nin người ta đã bắt đầu việc trồng trọt truyền
thống với mục đích duy trì và cải thiện chất lượng giống cây trồng nhằm thỏa mãn
yêu cầu của con người ngày một tốt hơn. Con người đã biết tạo ra giống cây trồng
mang các đặc tính mong muốn bằng phương pháp lai tạo giống (lai hữu tính giữa
hai dòng cây trồng). Phương pháp này cần nhiều thời gian, công sức và trong nhiều
trường hợp cây lai thu được kèm theo cả tính trạng không mong muốn.
Ngày nay, công nghệ gen sử dụng các phương pháp hiện đại đã khắc phục
được các hạn chế đó. Công nghệ gen cho phép các nhà di truyền và chọn giống thực
vật xác định và thiết kế các gen đặc hiệu cho các mục tiêu mong muốn (kể cả các
gen có nguồn gốc từ các sinh vật khác loài) rồi chuyển các gen này vào các giống
đang sử dụng, tạo ra những giống cây trồng biến đổi gen mang những đặc tính mới
đáp ứng yêu cầu của con người và có thể đem lại lợi ích quan trọng như tăng tính
chống chịu với các điều kiện ngoại cảnh bất lợi, tăng năng suất và chất lượng, cải
thiện môi trường nhờ giảm lượng thuốc trừ sâu hoá học cần sử dụng. Công nghệ
gen thực vật còn mở ra một khả năng mới là sử dụng thực vật như một nhà máy sản
xuất các loại thuốc cần thiết cho con người như vitamin, enzyme, kháng thể, vacxin
và các loại thuốc chữa bệnh khác [3].
Trong nghiên cứu chuyển gen thực vật, bên cạnh những gen có giá trị mã hoá
cho các tính trạng mong muốn, các promoter cần thiết cho sự biểu hiện của các gen
cũng nhận được sự quan tâm đặc biệt của các nhà nghiên cứu công nghệ gen thực
vật. Promoter là thành phần quan trọng trong cấu trúc của tất cả các gen, khởi đầu
cho sự phiên mã, đóng vai trò then chốt trong việc biểu hiện gen. Việc phân lập các
promoter biểu hiện gen hữu hiệu trên cây trồng, đặc biệt là promoter đặc hiệu cho
từng loại cây, biểu hiện trong các loại mô tế bào khác nhau ngày càng được quan
tâm đến. Nhiều promoter từ các gen ở thực vật được phân lập trong số đó phải kể
đến promoter ubiquitin gen ngô, promoter gen rbcS (ribulose – 1,5-bisphosphate
carboxylase small subunit), promoter của gen mã hóa sucrose synthase...[4].
Ubiquitin - protein sốc nhiệt (heat shock protein - HSP) với phân tử lượng nhỏ, có
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
1
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
mặt trong mọi tế bào ở tất cả các giai đoạn sinh trưởng, protein này tham gia vào
quá trình phân giải polypeptide trong tế bào chất, đóng vai trò quan trọng trong việc
bảo vệ tế bào và chuyển hóa các chất trong tế bào. Promoter của Ubiquitin gen từ
cây ngô được sử dụng rộng rãi trong công nghệ gen thực vật [22], [41], [53].
Bèo tấm là cây một lá mầm nhỏ nhất, có hàm lượng protein và
polysaccharide cao. Với đặc thù cấu trúc và quá trình trao đổi chất, bèo tấm được sử
dụng trong công nghệ gen thực vật như nhà máy sản xuất protein tái tổ hợp. Một số
promoter bèo tấm đã được phân lập như promoter của các gen SSU5A, SSU5B,
promoter của gen NPR1 (negatively phytochrome regulated1)... có phản ứng với
điều kiện chiếu sáng hoặc cảm ứng ABA trong các nghiên cứu về quá trình quang
hợp ở cây [18], [61]. Để tăng cường hiệu quả chuyển gen, ngoài sử dụng promoter
truyền thống như promoter 35S CAMV, promoter Ubiquitin từ loài bèo tấm Lemna
minor đã phân lập, nghiên cứu và hoàn thiện ở Mỹ, đã được đánh giá có hiệu quả
cao hơn và đăng ký thành patent [24]. Ở Việt nam có 3 loài bèo tấm được phát hiện
thấy là Lemna aequinoctialis, Spirodela polyrrhiza và Wolffia globosa ở nhiều vùng
khác nhau
Nhằm mục đích nghiên cứu phân lập promoter đặc hiệu từ các loài bèo tấm
Việt Nam phục vụ cho việc thiết kế tiếp theo các vector mang những gen đem lại lợi
ích cho con người để chuyển vào bèo tấm, chúng tôi xin đăng ký thực hiện đề tài:
“Nghiên cứu phân lập các yếu tố điều khiển biểu hiện gen Ubiquitin từ hai loài
bèo tấm Lemna aequinoctialis DB1 và Spirodela polyrrhiza DB2” với các nội
dung chính sau đây:
1. Hoàn thiện các phương pháp tách DNA tổng số từ hai loài bèo tấm Lemna
aequinoctialis DB1 và Spirodela polyrrhiza DB2;
2. Nghiên cứu thiết kế các mồi đặc hiệu và nhân đoạn các yếu tố điều khiển
biểu hiện gen đặc hiệu từ hai loài bèo tấm Lemna aequinoctialis DB1 và Spirodela
polyrrhiza DB2 bằng PCR;
3. Tách dòng và xác định trình tự đoạn các yếu tố điều khiển biểu hiện gen
đặc hiệu từ hai loài bèo tấm Lemna aequinoctialis DB1 và Spirodela polyrrhiza
DB2.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
2
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
Chƣơng 1
TỔNG QUAN TÀI LIỆU
1.1. Giới thiệu chung về cây bèo tấm
1.1.1. Phân bố của bèo tấm
Bèo tấm với tên khoa học Lemnaceae là loài sinh vật thủy sinh có khả năng
tồn tại và phát triển ở nhiều nơi trên thế giới, trừ những vùng cực bắc và cực nam
quanh năm giá lạnh. Ở vùng sa mạc và vùng ẩm ướt thì sự có mặt của bèo tấm cũng
ít hơn. Trong các chi thuộc loài bèo tấm thì 3 chi (Spirodela, Lemna, Wolffia) được
phân bố khắp thế giới, trong khi đó Wolffia ít tìm thấy ở châu Mỹ và châu Phi.
Spirodela có tâm phân bố ở Nam Mỹ. Chi Lemna có tính đa dạng cao nhất ở Bắc
Mỹ và Đông Nam Á. Wolffiella phân bố chủ yếu ở vùng ven nhiệt đới của châu Mỹ
và châu Phi. Wolffia tồn tại chủ yếu ở châu Mỹ, Đông Nam Á và châu Úc. Lemna
aequinoctialis được phân bố rộng rãi ở các vùng có khí hậu ấm áp trên thế giới.
Cùng với nghề trồng lúa nước, chúng có mặt rộng rãi ở nhiều vùng khác nhau như:
Nam Âu, vùng trung tâm Bắc Mỹ, Bắc Trung Quốc, Bắc Nhật Bản…[36]. Ở Việt
Nam, đã phát hiện thấy có 3 loài bèo tấm thuộc 3 chi khác nhau (Spirodela, Lemna,
Wolffia) đó là loài L. aequinoctialli, S. polyrrhiza và W. globosa [36]. Hiện nay,
các loài bèo này phân bố khá phổ biến trên các vùng mặt nước, ao hồ đồng ruộng và
tập trung nhiều ở khu vực đồng bằng Bắc Bộ và Nam bộ [7], [36].
1.1.2. Đặc điểm hình thái bèo tấm
Lemnaceae thuộc nhóm cây một lá mầm nhỏ nhất phần lớn có cả lá, rễ, hoa,
quả, những cây trưởng thành không có thân cây. Lá (cánh bèo) có kích thước khác
nhau phụ thuộc vào từng chi, từng loài.
1.1.2.1. Đặc điểm cánh bèo
Dạng thân giống lá của các loài Lemnaceae được gọi là “frond” (cánh bèo),
là một tập hợp của các mô có sự biệt hóa hạn chế. Mức độ tổ chức của mô cánh bèo
trong họ Lemnaceae giảm từ Spirodela tới Lemna, Wolffiella và Wolffia [36]. Cánh
bèo không ở dạng phẳng mà tồn tại các u lồi đặc trưng trên đó có định vị các gân lá,
cây trưởng thành thường có từ 4-7 gân lá trong khi các cây non chỉ có 3 gân lá. Đa
số bèo tấm có cánh mỏng giống lá. Một số loài có cánh không dẹt do có xoang khí
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
3
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
lớn. Cánh bèo có hình ô van (hoặc tròn) dài tới 1,5 cm và rộng tới 1 cm
(S. polyrrhiza, L. trisulca). Loài nhỏ nhất có cánh đạt kích thước 3 mm ở điều kiện
tối ưu. Ở điều kiện thường có thể nhỏ hơn 1 mm (Wolffia). Kích thước và hình dạng
của cánh bèo phụ thuộc nhiều vào các điều kiện bên ngoài và kiểu gen của chúng.
Các yếu tố ngoại cảnh này bao gồm: ánh sáng, hàm lượng đường, hàm lượng nitơ,
phospho, kali, canxi và magie, nhiệt độ…[36].
1.1.2.2. Đặc điểm rễ bèo
Kích thước và số lượng rễ trên 1 cánh bèo ở các loài bèo tấm không giống
nhau và phụ thuộc vào từng loài [36]. Đa số các loài thuộc họ Lemna chỉ có một rễ,
S. polyrrhiza có từ 7-12 rễ hoặc nhiều hơn và có thể dài đến 10 mm, Landoltia có 23 rễ và có thể lên đến 5 rễ với chiều dài tối đa có thể đạt được là 6 mm. Ngoại trừ
điều kiện khắc nghiệt, trong điều kiện thiếu nitơ, phosphate hay các chất khoáng, rễ
sẽ dài hơn. Trong khi đó, trong môi trường dinh dưỡng thuận lợi, rễ ngắn hơn và
thậm chí có loại không hình thành rễ. Cấu trúc rễ của bèo tấm cũng hết sức đơn
giản, không có các rễ con và không phản ánh sự tăng trưởng cũng như sự tạo nhánh.
Vì lẽ đó, rễ của bèo tấm rất mảnh và nhỏ. Cũng giống như các loại rễ phổ biến khác,
rễ bèo tấm có cấu tạo gồm 4 phần chính: Đỉnh rễ, vùng mô phân sinh, vùng kéo dài,
và vùng các tế bào thuần thục.
1.1.2.3. Hoa và quả bèo
Hoa của các loài bèo tấm đã được nghiên cứu tương đối kĩ. Chúng thường
hình thành và tồn tại trong thời gian ngắn và hiếm khi được quan sát thấy. Hoa của
các loài bèo có thể hình thành trong thời gian ngắn hay dài khác nhau tuỳ thuộc vào
loài. Mỗi hoa thường có 2 nhị hoa và 1 vòi nhụy hoa duy nhất. Các nhụy hoa
thường ngắn và khó quan sát hơn. Quả của bèo tấm đa phần là nhỏ, có lớp vỏ ngoài
khô, một số trong đó có thể được quan sát thấy bằng mắt thường. Quả bèo thường
có dạng như một túi có răng cưa, đôi khi có dạng dọc hơi phẳng, và thường chứa từ
1-6 hạt [36]. Hình 1.1 thể hiện một số đặc điểm của hoa bèo tấm.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
4
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
Hình 1.1. Hoa của Lemna gibba
1.1.3. Cây phân loại bèo tấm
Hình 1.2. Cây phân loại bèo tấm theo Landolt và cộng sự
Theo Landolt, bèo tấm thuộc giới thực vật, ngành Magnoliophyta, lớp
Liliopsida, bộ Arales, họ Lemnaceae gồm các chi Lemna, Spirodela, Wolffia,
Woffiela với trên 40 loài khác nhau [36]. Ông đã phân loại bèo tấm dựa trên số rễ và
kích thước của cánh bèo: Lemna (1 rễ); Spirodela (7-12) rễ; cánh bèo từ 10 mm trở
lên); Landoltia (2-3 rễ, cánh bèo 3-6 mm); Wolffia (không có rễ, cánh bèo 0,6-1,2
mm)…
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
5
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
Năm 2002, Les và cộng sự đã dựa trên đặc điểm về hình thái nhiễm sắc thể
và vi phân tử (DNA của nhân và lục lạp) đề ra giả thiết về cây phân loại của bèo
tấm gồm 5 chi tức là có thêm một chi mới là Landoltia [38].
Một số nghiên cứu gần đây của Rothwell và cộng sự, dựa trên sự so sánh
trình tự đoạn intron tRNALeu UAA (trnL) và tRNAPhe UAA (trnF) của bộ gen lục
lạp đã xác định rằng họ Lemnaceae và Pisita cùng thuộc họ ráy Araceae [48]. Hình
1.2 biểu thị cây phân loại bèo tấm [37].
1.1.4. Hình thức sinh sản của bèo tấm
Bèo tấm có hai phương thức sinh sản để duy trì nòi giống: Sinh sản hữu tính
và sinh sản vô tính. Sinh sản vô tính chiếm ưu thế so với sinh sản hữu tính. Hình
thức sinh sản hữu tính của bèo tấm chỉ xảy ra khi chúng gặp điều kiện bất lợi để bảo
tồn nòi giống [36], [37].
1.1.4.1. Sinh sản vô tính
Bèo tấm sinh sản vô tính bằng hình thức nảy chồi từ vùng đỉnh phân sinh
nằm trong xoang ở vùng gốc cánh. Hình 1.3 thể hiện quá trình sinh sản vô tính bằng
hình thức nảy chồi của S. polyrrhiza.
Hình 1.3. Sinh sản vô tính bằng hình thức nảy chồi ở S. polyrrhiza
Ở điều kiện tối ưu, tốc độ sinh sản vô tính của bèo tấm gần đạt mức tăng theo
hàm số mũ. Lượng cánh bèo có thể tăng gấp đôi chỉ sau 24 giờ nuôi cấy ở các loài
sinh trưởng nhanh như L. aequinoctialis, W. microscopica. Với hình thức sinh sản
vô tính thì thời gian một vòng đời của cánh bèo chỉ vài tuần. Theo nhiều tác giả cho
biết, vòng đời của một cánh bèo phụ thuộc vào nhiệt độ nuôi, ở 30 oC vòng đời giảm
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
6
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
một nửa so với ở 20oC. Trong giai đoạn ngủ, nghỉ và ở nhiệt độ thấp, cánh bèo có
thể tồn tại trong vài tháng. Điều kiện dinh dưỡng cũng có ảnh hưởng đến vòng đời
của cánh bèo. Sự thiếu hụt các chất dinh dưỡng có thể làm cánh bèo già hoá nhanh
và chết chỉ sau 1 đến 2 tuần. Có thể nói, vòng đời sẽ dài hơn khi tốc độ nhân lên của
cánh bèo nhỏ. Khi nồng độ dinh dưỡng giảm dưới ngưỡng tối thiểu thì cánh bèo bị
tổn thương và chết nhanh hơn bình thường [36].
1.1.4.2. Sinh sản hữu tính
Sinh sản hữu tính được thực hiện thông qua sự ra hoa và tạo hạt tương tự như
các loài thực vật hạt kín khác. Với kích thước cánh bèo, hoa và hạt nhỏ bé, bèo tấm
được coi là loài thực vật hạt kín nhỏ bé nhất trong giới thực vật. Sinh sản hữu tính ở
bèo tấm bao gồm 2 giai đoạn: (i) Ra hoa và (ii) Tạo quả và hạt.
* Giai đoạn ra hoa: Cơ quan ra hoa ở bèo tấm L. aequinoctialis gồm các
thành phần: 1 lá bắc, 2 nhị hoa, 1 nhụy hoa. Ở Spirodela và Lemna, các cơ quan của
hoa phát sinh trong xoang phát sinh cánh con. Ở Wolffiella và Wolffia, hoa phát sinh
trong 1 xoang ở bề mặt trên của cánh bèo và không ở cung xoang phát sinh cánh
con. Hoa của Wolffia nằm dọc theo đường trung tâm cánh. Hoa của Wolffiella nằm
ở cạnh đường trung tâm của cánh [36].
* Giai đoạn tạo quả và hạt: Sau khoảng thời gian từ 2 đến 5 tuần tính từ lúc
thụ tinh thì quả chín. Mỗi quả có lá bao khô và thường có 1 - 6 hạt. Ở hầu hết các
loài, quả gần như đối xứng ngoại trừ L. valdiviana và L. perpusilla. Quả thường dài
từ 0,35 mm đến 2,75 mm. Hạt bèo tấm có dạng hình trứng với 1 vảy đen ở đỉnh.
Khi quả có nhiều hơn 1 hạt thì quả có thể ở dạng hình trứng hoặc tam giác. Kích
thước hạt biến đổi trong cùng một loài và giữa các loài từ 0,3 – 2 mm về chiều dài
và 0,2 – 0,8 mm về đường kính. Hạt có vỏ hạt ngoài và vỏ hạt trong, nội nhũ và
phôi. Vỏ ngoài gồm 2 – 11 lớp tế bào của biểu bì ngoài, ở đỉnh có nhiều lớp tế bào
hơn ở giữa và cuối hạt [36].
1.1.5. Hệ gen của bèo tấm
Các nghiên cứu đối với hệ gen bèo tấm được tiến hành từ đầu những năm 80
của thế kỷ trước cho đến ngày nay. Các kết quả cho thấy, bộ gen bèo tấm giống với
bộ gen của thực vật nói chung, bao gồm gen nhân và gen ngoài nhân. Bộ gen của
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
7
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
bèo tấm có kích thước rất nhỏ, (lượng DNA trên 01 nhiễm sắc thể: 1C=0,6 pg
DNA) trong khi đó ở các loài thực vật khác như Triticum monococcum bộ gen lớn
hơn nhiều (1C=6,23 pg) [54]. Kích thước gen nhân của các loài bèo tấm là khác
nhau, nhỏ nhất ở Spirodela và lớn nhất ở Wolffia. Số lượng nhiễm sắc thể ở các loài
khác nhau cũng rất khác nhau từ 2n = 16 đến 2n = 126. Kích thước bộ gen của một
số loài bèo tấm so với các loài đối chứng được liệt kê trên bảng 1.1 [36].
Bảng 1.1. Kích thƣớc gen nhân của một số loài bèo tấm
Loài
2n
pg DNA
pg DNA /
pg DNA /
1C
chromsome
Spirodela polyrrhiza 7110
80
1.19 / 8C
0.15
0.015
Spirodela punctata 7461
46
1.48 / 4C
0.37
0.032
Lemna minor 7115
126
5.82 / 12C
0.49
0.046
Wolffiella oblonga 79 (7166)
Wolffia arrhiza 7347
42
42
3.02 / 4C
6.53 / 4C
0.76
1.63
0.072
0.155
Gen ngoài nhân của bèo tấm bao gồm gen lục lạp và gen ty thể. Gen lục lạp
(cpDNA) của bèo tấm là đối tượng được quan tâm nghiên cứu nhiều nhất. Tháng 5
năm 2008, bộ gen lục lạp của Lemna minor đã giải trình tự hoàn chỉnh. Bộ gen lục
lạp có cấu trúc mạch vòng bao gồm 165 955 bp mã hóa cho 112 gen (78 gen mã hóa
protein, 30 tRNA gen và 4 rRNA gen [42].
1.1.6. Giá trị dinh dƣỡng
Bèo tấm có chứa các chất dinh dưỡng với sự đa dạng về cả thành phần và
hàm lượng. Sinh khối bèo tấm có chứa các vitamin A, B1, B2… và các amino acid
không thay thế trừ methionine. Bèo tấm nuôi ở điều kiện tối ưu là một trong số các
loài thực vật cho hàm lượng protein tổng số đạt giá trị cao nhất. Hầu hết các loài
bèo tấm có hàm lượng protein đạt từ 6,8 – 45% phụ thuộc chủ yếu vào điều kiện
nuôi cấy [37]. Trong thời gian gần đây, đã có các nghiên cứu sử dụng bèo tấm như
là hệ thống sinh tổng hợp các chất thứ cấp, các sản phẩm mang lợi ích cho người
dân, các protein với hàm lượng lớn và hoạt tính sinh học cao…[38]. Các yếu tố ảnh
hưởng tới hàm lượng protein trong cánh bèo gồm có: ánh sáng, nhiệt độ, thành phần
và hàm lượng khoáng chất trong môi trường nuôi (đặc biệt là nitơ). Thành phần và
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
8
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
hàm lượng các chất dinh dưỡng và các thành phần hữu cơ khác của bèo tấm được
liệt kê ở bảng 1.2.
Bảng 1.2. Thành phần và hàm lƣợng các hợp chất hữu cơ có trong cánh bèo
Thành phần
Hàm lượng (% trọng lượng chất khô)
Proteins
6,8 – 45
Lipid
1,8 – 9,2
Sợi thô
5,7 – 16,2
Đường
14,1 – 43,6
Tro
12,0 – 27,6
1.1.7. Tiềm năng sử dụng bèo tấm trong công nghệ sinh học
Một trong những mục đích chủ yếu của công nghệ sinh học, đặc biệt là công
nghệ DNA tái tổ hợp là tạo ra các sản phẩm chuyển gen có giá trị thương mại cao.
Để có thể tiến hành ứng dụng công nghệ sinh học trong quy mô sản xuất lớn, một
đòi hỏi cấp thiết là cần phải có hệ thống tái sinh tốt với khả năng sinh trưởng và
phát triển nhanh, ổn định [13]. Cho đến nay, các nhà công nghệ sinh học phân tử đã
và đang sử dụng nhiều hệ thống sinh học bao gồm: vi khuẩn, nấm, các dòng tế bào
côn trùng, thực vật, động vật có vú, virus của côn trùng, của thực vật, các sinh vật
đa bào…Việc lựa chọn hệ thống sinh học phụ thuộc phần lớn vào sản lượng và chất
lượng thương phẩm. Hệ thống sinh học từ vi khuẩn có khả năng tạo ra protein với
hàm lượng cao nhưng hoạt tính của các protein thu được có một số hạn chế nhất
định. Các tế bào động vật bậc cao có khả năng cải biến tốt các protein sau dịch mã
nhưng lại tiềm ẩn các tác nhân gây bệnh có nguồn gốc virus do chúng là ký chủ cho
nhiều loại virus gây bệnh cho người và gia súc. Do đó nhiệm vụ của các nhà sinh
học phân tử là tìm ra được các hệ thống sản xuất protein khác đảm bảo các yêu cầu:
rẻ tiền, dễ sử dụng và không mang nguy cơ lây nhiễm các bệnh có nguồn gốc virus.
Hệ thống đó là thực vật. So với các hệ thống truyền thống, thực vật có nhiều lợi thế
trong việc sản xuất protein tái tổ hợp. Trước hết phải kể đến khả năng glycoside hóa
các protein, bởi các glycoprotein là nhóm protein có vai trò quan trọng trong các
phản ứng miễn dịch. Lợi thế thứ hai là protein tạo thành từ thực vật tương đối an
toàn so với protein có nguồn gốc động vật bậc cao. Thứ ba là lợi thế về giá thành,
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
9
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
thực vật có thể trồng trên diện tích lớn với chi phí tối thiểu về phân bón, công chăm
sóc và nguyên liệu đầu vào.
Trong các loài thực vật được nghiên cứu để làm hệ thống tái sinh, các loài
thuộc họ bèo tấm đang được đặc biệt quan tâm với vòng đời ngắn và khả năng tăng
sinh khối nhanh. Bèo tấm có tốc độ sinh sản rất nhanh, nhân đôi trọng lượng trong
vòng 24 – 72 giờ. Một số giống bèo tấm có tốc độ tăng sinh khối cao hơn hẳn so với
các loài thực vật khác. Đối với cây ngô, từ 1 g chất khô ban đầu, sau một tuần
không thể tạo ra lượng chất khô lớn hơn 2,3 kg. Trong khi đó một số loài bèo tấm
lại có thể tạo ra 64 g chất khô từ 1 g chất khô ban đầu sau 1 tuần [31], [50].
Mặt khác hàm lượng các chất dinh dưỡng của bèo tấm rất cao với sự đa dạng
về thành phần các vitamin (A, B1, B2…), các amino acid không thay thế. Riêng
protein của bèo tấm có thể đạt từ 6,8 – 45 % trọng lượng khô tuỳ theo loài [36], tức
là tỷ lệ tương đương với đậu tương. Theo tính toán, chỉ cần 1 - 3 % tổng số protein
nói trên có hoạt tính sinh học quan tâm là đủ để bèo tấm được coi là hệ thống tái
sinh hiệu quả. Do những ưu điểm đó, trong những năm gần đây, đã có nhiều nghiên
cứu chuyển gen để sản xuất các hoạt chất sinh học từ bèo tấm. Các nhà khoa học
Mỹ, Israel, Pháp đã sử dụng các loài Lemna để chuyển các gen có giá trị kinh tế,
nhằm sản xuất các hoạt chất sinh học khác nhau trong đó có vacine. Quy trình
chuyển gen vào bèo tấm cũng tương tự như quy trình biến nạp gen ở một số loài
thực vật khác, tức là phải tạo vật liệu vô trùng trong ống nghiệm, tạo callus, sau đó
tái sinh callus đã chuyển gen thành cây hoàn chỉnh. Ngoài ra, các loài thuộc họ bèo
tấm còn có khả năng chuyển gen sử dụng nguyên cây mà không cần nuôi cấy mô và
vật liệu vô trùng. Tháng 10 năm 2004, chính phủ Pháp đã tài trợ để thành lập công
ty Lemnagene nhằm mục đích nghiên cứu ứng dụng bèo tấm đối với công nghệ sinh
học [68].
1.2. Promoter và ứng dụng trong công nghệ gen thực vật
1.2.1 Cấu trúc gen sinh vật
Gen là một đoạn phân tử DNA, RNA, mang thông tin di truyền xác định cấu
trúc của một chuỗi polypeptide hoặc một phân tử RNA nhất định. Một gen có cấu
trúc điển hình gồm ba vùng chính: Vùng điều khiển, vùng mang mã di truyền và
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
10
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
vùng kết thúc. Vùng điều khiển có một số trình tự đặc hiệu điều khiển hoạt động
gen. Vùng mang mã chứa các thông tin di truyền, được phiên mã sang RNA thông
tin (mRNA), gen cấu trúc có thể được dịch mã tạo ra sản phẩm là các protein. Vùng
kết thúc mang trình tự phân biệt giữa các gen, và các trình tự kết thúc quá trình
phiên mã. Cấu trúc gen còn bao gồm một số cấu trúc đặc thù nằm ở phía trước, phía
sau hoặc trong gen như các trình tự điều hòa, vùng tăng cường (enhanor), vùng bất
hoạt (silencer), vùng đệm (spacer)… [39]. Hình 1.4 là sơ đồ cấu trúc 1 gen điển
hình.
Hình 1.4. Sơ đồ cấu trúc gen điển hình
1.2.2 Cấu trúc promoter
Gen cấu trúc có thể biểu hiện được thành protein cần sự có mặt của các trình
tự điều khiển thích hợp nằm ở những vị trí nhất định. Trình tự tham gia tích cực vào
quá trình điều khiển biểu hiện gen là trình tự khởi động (promoter). Promoter bao
gồm trình tự nucleotide nằm ngược phía trên đầu 5’ so với vị trí khởi đầu phiên mã
gen (transcription start site – TSS), đóng vai trò điều khiển quá trình phiên mã nhờ
khả năng đảm bảo các vị trí nhận biết cho các protein tham gia vào việc điều khiển
biểu hiện gen như enzyme RNA polymerase, các nhân tố phiên mã (transcription
factor – TF). Tùy thuộc vào khoảng cách từ TSS, các thuật ngữ “promoter gần” hay
“promoter tối thiểu” (khoảng vài trăm nucleotide quanh vùng TSS) (proximal
promoter hay minimal promoter ) và “promoter xa” (hàng nghìn nucleotide ở phía
trên TSS) (distal promoter) có thể được sử dụng. Cả hai loại promoter gần và xa đều
chứa rất nhiều yếu tố tham gia vào quy trình phức tạp của các nhân tố điều hòa
phiên mã đặc hiệu tế bào, mô, cơ quan, giai đoạn phát triển và môi trường [3], [53].
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên
11
http://www.Lrc-tnu.edu.vn
- Xem thêm -